R&D Engineer (Data Algorithms)

About us:

Nomic was founded with the purpose of making biology easier to measure.
To do this, we have untangled some of the most difficult problems in protein profiling.
Our team is combining DNA nanotechnology, high-dimensional flow cytometry, laboratory automation, and machine learning to develop the world's highest throughput proteomic platform: the nELISA.


Since spinning out of McGill University, we have partnered with and provided platform access to dozens of drug discovery groups including GSK, 4 of the top 10 pharmas, and leading biotechs.
We have recently launched a state of the art manufacturing and protein profiling facility that enables multiplexed measurement of >2.5M samples a year, generating an effective 500M protein assays in the process.


We are building a diverse team of engineers, scientists, and world-changers.
We like to break down difficult problems using a first principles approach, often leveraging the latest breakthroughs from across the scientific and technological spectrum to drive our mission forward.


Nomic is headquartered in Montreal, Canada with a satellite research lab in Boston, Massachusetts.
The majority of our team is based in Montreal and works in a new, shared office/laboratory space.


About the role:

Our Data team's mission is to design, build, operate and improve the data pipelines needed for analyzing nELISA data at scale.
Strong fundamentals in data science and data algorithms is key to our vision of the future, and every aspect of our company today is geared towards generating more useful proteomic data.
In the lab we are scaling the nELISA to generate higher plex and lower cost proteomic data points, and outside the lab we help our users to best leverage nELISA data for their biological research.


Our development roadmap includes building more robust data pipelines for decoding nELISA datasets, generating advanced and application-specific bioinformatic pipelines to help customers understand their unique datasets, and developing improved internal-facing tools that will let us execute faster in the lab by extracting insights from our nELISA profiling and manufacturing QC data on-demand.


As an R&D Engineer focused on data algorithms, you will bridge our in-lab technology development efforts with engineering improved data processing algorithms.
Specifically, you will play a critical, first-hand role in developing core improvements to the data pipelines and data algorithms we use for processing all things nELISA data.
Day to day this role will consist of:
You will primarily be responsible for designing, building, iteratively improving, and fully automating the data pipelines and algorithms we use for processing raw flow cytometry data from our highly multiplexed bead-based assays into quantitative protein measurements.
This will be done in close collaboration with your Data Engineering, Software Engineering, and Lab R&D teammates.
You will leverage your fundamental knowledge of biosensors, fluorescence data, and bioengineering R&D to act as an expert for the interpretation, and analysis of, nELISA experimental data coming from R&D and day-to-day Lab Operations, connecting the fundamentals of the science to the specifics of the data.
You will also support R&D and Lab Operations teams through developing additional data support features and algorithms to support the growth of Nomic going forward.
This will include any new data analysis pipelines to analyze nELISA data, including QC data from our daily manufacturing and profiling operations.
This role will involve substantial communication, teamwork, and attention to detail, especially when identifying and troubleshooting issues related to nELISA data and ensuring we build the right tools, and the right abstractions, for our teammates and for customers.
When tooling does not yet exist, you will be responsible for analyzing nELISA data using our suite of decoding and analysis tools, as well as leveraging your technical and bioscience domain expertise to develop new data analysis pipelines when needed.
You will be relied on to support the R&D and Lab Operations teams with guidance on experimental design and analysis when needed.
What we're looking for: PhD degree in bioengineering (or a related engineering-focused field of study), or equivalent experience in industry, with a focus on biosensor platforms, quantitative fluorescence data, or similar.
3+ years of experience specifically with analyzing bioscience data and developing improved data processing algorithms.
2+ years software engineering/development experience (i.e.
you must be comfortable coding in a collaborative environment with more experienced software engineers).
Statistical skills including bayesian statistics, sampling methods, mixed models, and other statistical concepts.
Highly proficient in proteomic tools and their associated methods.
In particular you would be an expert on multiple of: immunoassays, nucleic acid amplification, DNA nanoarchitecture and design, separation-based techniques for biological samples and compounds, biophysics / fluorescence, and signal processing.
Together with deep knowledge of, and first hand experience optimizing: surface chemistry (passivation, functionalization, regeneration), DNA-based circuits and DNA biosensor designs, fluorophores/fluorescence and FRET, antibody-antigen interactions and ligand binding, and all things to do with bead-based biosensors.
Experience working collaboratively on data science problems with wet lab scientists, ideally in a startup or equivalent fast paced environment.
Excellent communication skills (written, verbal, and in a codebase) and an independent problem solver.
Join us if you: Connect deeply with our mission, ambition and sense of duty.
Our mission isn't marketing flash: we developed our technology to better measure biology and discover biomarkers for early disease detection.
We firmly believe we will be successful in literally eradicating certain diseases by enabling them to be diagnosed earlier.
We also believe that our hard work to bring this technology to its full potential is our duty.
Are up for a challenge and want to grow: We are a team of problem-solvers, and we continually put ourselves to the test and go into the unknown.
We have a growth mindset, both on hard and soft skills, and we rely on each other to give critical and candid feedback to ensure that we can all reach our full potential.
Want to be at the cutting-edge of biotechnology.
The nELISA is a new tool that leverages DNA nanotechnology to generate proteomic data more efficiently than ever before.
You get to design and build the data pipelines that will support the scaling of this technology going forward.
Love writing code and analyzing biological data, and want to be responsible for driving improvements to data pipelines from a full-stack perspective.
Prefer working and communicating within a diverse cross-functional team.
You would get to interface with your teammates from the broader Engineering, Operations, and Commercial teams on a daily basis, joining a collaborative, diverse, and inclusive team where your ideas will be valued.
Want the responsibility of addressing some of our hardest problems.
Data is one of our core competencies, and researching and developing improvements to the way we analyze data has a compounding benefit on all other aspects of our company and our customers, most notably the scientists using the nELISA and patients that will ultimately benefit from nELISA data.
If you are passionate about building algorithms and data pipelines for biology, want to drive innovation in proteomics, and are eager to make a meaningful impact in the world, we invite you to apply and join us on our journey to redefine proteomics and the understanding of biology.


propos de nous:

Nomic a t fonde dans le but de rendre la biologie plus facile mesurer.
Pour ce faire, nous avons dml certains des problmes les plus difficiles dans le profilage des protines.
Notre quipe combine la nanotechnologie ADN, la cytomtrie en flux haute dimension, l'automatisation des laboratoires et l'apprentissage automatique pour dvelopper la plateforme de protomique la plus performante au monde : la nELISA.


Depuis que nous avons merg de l'Universit McGill, nous avons collabor et fourni l'accs notre plateforme des dizaines de groupes de dcouverte de mdicaments, tels que GSK, 4 des 10 plus grandes entreprises pharmaceutiques et des entreprises de biotechnologie de premier plan.
Nous avons rcemment mis sur pied une technologie innovatrice de fabrication et de profilage de protines qui permet la mesure multiplexe de plus de 2,5 millions d'chantillons par anne, ce qui gnre concrtement 500 millions d'analyse de protines au courant du processus.


Nous constituons une quipe diversifie d'ingnieurs, de scientifiques et de changeurs du monde.
Nous aimons dcomposer les problmes difficiles en utilisant une approche de principes fondamentaux, souvent en exploitant les plus rcentes avances scientifiques et technologiques pour faire progresser notre mission.


Le sige social de Nomic est situ Montral, Canada, avec un laboratoire de recherche satellite Boston, Massachusetts.
La majorit de notre quipe est base Montral et travaille dans un nouvel espace de bureaux/laboratoires partags.


propos du poste:

La mission de notre quipe Data est de concevoir, construire, exploiter et amliorer les pipelines de donnes ncessaires pour analyser les donnes nELISA grande chelle.
Des bases solides en science des donnes et en algorithmes de donnes sont essentielles pour notre vision de l'avenir, et chaque aspect de notre entreprise aujourd'hui est orient vers la gnration de donnes protomiques plus utiles.
Au laboratoire, nous dveloppons le nELISA pour gnrer des points de donnes protomiques plus haut multiplexage et cot rduit, et en dehors du laboratoire, nous aidons nos utilisateurs tirer le meilleur parti des donnes nELISA pour leurs recherches biologiques.


Notre feuille de route de dveloppement inclut la construction de pipelines de donnes plus robustes pour dcoder les ensembles de donnes nELISA, la gnration de pipelines bioinformatiques avancs et spcifiques aux applications pour aider les clients comprendre leurs ensembles de donnes uniques, et le dveloppement d'outils internes amliors qui nous permettront d'excuter plus rapidement au laboratoire en extrayant des informations de nos donnes de profilage nELISA et de contrle de qualit de fabrication la demande.


En tant qu'Ingnieur R&D spcialis dans les algorithmes de donnes, vous ferez le lien entre nos efforts de dveloppement technologique en laboratoire et l'ingnierie des algorithmes de traitement des donnes amliors.
Plus prcisment, vous jouerez un rle essentiel et direct dans le dveloppement des amliorations fondamentales des pipelines de donnes et des algorithmes de donnes que nous utilisons pour traiter toutes les donnes nELISA.
Au quotidien, ce rle consistera : Vous serez principalement responsable de la conception, de la construction, de l'amlioration itrative et de l'automatisation complte des pipelines de donnes et des algorithmes que nous utilisons pour traiter les donnes brutes de cytomtrie en flux issues de nos tests multiplexs bass sur des billes en mesures quantitatives de protines.
Cela se fera en troite collaboration avec vos collgues en ingnierie des donnes, en ingnierie logicielle et en recherche et dveloppement en laboratoire.
Vous utiliserez vos connaissances fondamentales en biosenseurs, donnes de fluorescence et recherche et dveloppement en bioingnierie pour agir en tant qu'expert dans l'interprtation et l'analyse des donnes exprimentales nELISA provenant de la R&D et des oprations quotidiennes du laboratoire, en reliant les fondamentaux scientifiques aux spcificits des donnes.
Vous soutiendrez galement les quipes de R&D et des oprations de laboratoire en dveloppant des fonctionnalits et des algorithmes supplmentaires pour soutenir la croissance de Nomic l'avenir.
Cela inclura tout nouveau pipeline d'analyse de donnes pour analyser les donnes nELISA, y compris les donnes de contrle qualit issues de nos oprations de fabrication et de profilage quotidiennes.
Ce rle impliquera une communication substantielle, un travail d'quipe et une attention aux dtails, en particulier lors de l'identification et du dpannage des problmes lis aux donnes nELISA et en veillant ce que nous construisions les bons outils et les bonnes abstractions pour nos collgues et nos clients.
Lorsque les outils ncessaires n'existent pas encore, vous serez responsable de l'analyse des donnes nELISA en utilisant notre suite d'outils de dcodage et d'analyse, ainsi que d'exploiter votre expertise technique et en biosciences pour dvelopper de nouveaux pipelines d'analyse de donnes si ncessaire.
Vous serez sollicit pour soutenir les quipes de R&D et des oprations de laboratoire en fournissant des conseils sur la conception exprimentale et l'analyse lorsque cela sera ncessaire.
Ce que nous recherchons : Doctorat en bioingnierie (ou dans un domaine d'tude similaire ax sur l'ingnierie), ou exprience quivalente dans l'industrie, avec une spcialisation dans les plateformes de biosenseurs, les donnes de fluorescence quantitative ou un domaine similaire.
Plus de 3 ans d'exprience spcifique dans l'analyse de donnes en biosciences et le dveloppement d'algorithmes amliors de traitement des donnes.
Plus de 2 ans d'exprience en ingnierie/dveloppement logiciel (c'est--dire que vous devez tre l'aise pour coder dans un environnement collaboratif avec des ingnieurs logiciels plus expriments).
Comptences statistiques incluant les statistiques baysiennes, les mthodes d'chantillonnage, les modles mixtes et d'autres concepts statistiques.
Matrise avance des outils protomiques et de leurs mthodes associes.
En particulier, vous seriez un expert dans plusieurs domaines : immunoessais, amplification des acides nucliques, nanoarchitecture et conception de l'ADN, techniques de sparation pour chantillons biologiques et composs, biophysique / fluorescence et traitement du signal.
Connaissance approfondie et exprience directe dans l'optimisation de : chimie de surface (passivation, fonctionnalisation, rgnration), circuits base d'ADN et conceptions de biosenseurs ADN, fluorophores/fluorescence et FRET, interactions anticorps-antigne et liaison des ligands, et tout ce qui concerne les biosenseurs billes.
Exprience de travail collaborative sur des problmes de science des donnes avec des scientifiques de laboratoire humide, de prfrence dans une startup ou un environnement rapide quivalent.
Excellentes comptences en communication (crite, verbale et dans le code) et capacit rsoudre des problmes de manire autonome.
Joignez-vous notre quipe si: Notre mission vous stimule, rpond vos ambitions et votre sens du devoir.
Notre mission n'est pas un simple coup de publicit : nous avons dvelopp notre technologie pour mieux mesurer la biologie et dcouvrir des biomarqueurs pour la dtection prcoce des maladies.
Nous croyons fermement que nous russirons radiquer littralement certaines maladies en permettant leur diagnostic plus tt.
Nous croyons galement que notre travail acharn pour amener cette technologie son plein potentiel est notre devoir.
Vous tes prt(e) relever un dfi et grandir : nous sommes une quipe de solutionneurs de problmes, et nous nous mettons constamment l'preuve et plongeons dans l'inconnu.
Nous avons une mentalit de croissance, tant sur les comptences techniques que gnrales, et nous comptons les uns sur les autres pour donner des retours critiques et francs afin de nous assurer que nous puissions tous atteindre notre plein potentiel.
Vous souhaitez tre la pointe de la biotechnologie.
La nELISA est un nouvel outil qui exploite la nanotechnologie ADN pour gnrer des donnes protomiques plus efficacement que jamais auparavant.
Vous aurez la possibilit de construire et d'exploiter les pipelines de donnes qui soutiendront l'volution de cette technologie.
Vous aimez analyser des donnes biologiques et crire du code, et souhaitez apprendre amliorer une pipeline de donnes d'une perspective full-stack.
Vous prfrez travailler et communiquer au sein d'une quipe diversifie et multi-disciplinaire.
Vous serez en contact avec des collgues des quipes R&D, Ingnierie, Oprations et Commerciale au quotidien, rejoignant une quipe collaborative, diversifie et inclusive o vos ides seront valorises.
Vous voulez la responsabilit de rsoudre certains de nos problmes les plus difficiles.
Les donnes sont l'une de nos comptences de base, et la recherche et le dveloppement d'amliorations de notre manire d'analyser les donnes ont un bnfice cumulatif sur tous les autres aspects de notre entreprise et de nos clients, notamment les scientifiques utilisant la nELISA et les patients qui bnficieront en fin de compte des donnes nELISA.


Si vous tes passionn(e) par la cration d'algorithmes et de pipelines, souhaitez stimuler l'innovation en protomique, et dsirez avoir un impact significatif sur le monde, nous vous invitons postuler et nous rejoindre dans notre mission de redfinir la protomique et la comprhension de la biologie.